티스토리

rrimyuu 님의 블로그

검색하기

블로그 홈

rrimyuu 님의 블로그

rrimyuu.tistory.com/m

rrimyuu 님의 블로그 입니다.

구독자: 2

방명록 방문하기

주요 글 목록

TypeError: ufunc 'invert' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe'' TypeError: ufunc 'invert' not supported for the input types, and the inputs could not be safely coerced to any supported types according to the casting rule ''safe'' ground_truth = np.asarray(ground_truth, dtype=int) # addedassert np.array_equal(np.unique(ground_truth), [0, 1])order = (~ground_truth).argsort() 공감수 0 댓글수 1 2024. 10. 16.
The filename, directory name, or volume label syntax is incorrect.The filename, directory name, or volume label syntax is incorrect.ERROR conda.cli.main_run:execute(47): The filename, directory name, or volume label syntax is incorrect. The filename, directory name, or volume label syntax is incorrect. ERROR conda.cli.main_run:execute(47): 어느 순간부터 pip 명령어가 안 들어서 python -m pip 이렇게 명령어를 입력하다가 어느 순간부터 conda 로 설치한 패키지가 인식이 안되기 시작하였음. 최종적으로는 위 에러 코드가 뜨면서 잘 돌아가던 코드가 먹통이 되어버렸는데 나의 경우는 version 3.8.16 을 사용하고 있었고 지원이 끝났다는 것을 알게 됨. 그래서 아래 명시되어있는대로 3.8.20 을 설치해주니까 다시 잘 작동되.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 10. 15.
SHAP FORCE_PLOT 출력 안됨 에러. plt.rc('font', family='Malgun Gothic')fig = plt.figure(figsize=(8, 8))shap.initjs()shap.force_plot(explainer.expected_value.numpy()[0], shap_values[0,:], _X.iloc[0,:], matplotlib=True)plt.show() matplotlib = True 로 해주면 됨. 공감수 1 댓글수 0 2024. 9. 12.
Paper review | Finding the Right XAI Method—A Guide for the Evaluation and Ranking ofExplainable AI Methods in Climate Science 1. Introduction 기후 과학 분야서 널리 사용되는 deep learning But, 의사결정 과정 이해 어려운 deep neural network 높은 예측 성능 뿐만 아니라 기존 이론과 일치하는 예측 이유 제공하는 DNN 필요 해석 불가능성 문제를 해결하는 explainable AI Ante Hoc method vs. Post Hoc method DNN architecture 수정 필요한 Ante Hoc method-> Self-explaining neural networks But, 모든 NN 에 적용 가능한 Post Hoc method설명 대상 기준: Local vs. Global 설명 산출시 사용 요소 기준: Model aware method vs. Model agnostic.. 공감수 1 댓글수 0 2024. 8. 26.
무지성 후지산 당일치기 등반 후기 (8월 중순/ 요시다 루트/ 새벽 3시-오후 4시30분/ 예약 x/ 등산 준비 x) 나중에 혹시 후지산을 또 오르게 될 날이 있다면 참고하고자 글을 적어봅니다. 후지산 등반은 총 4개 루트로 구성되어있고 일반적으로 요시다 루트 (등산 6시간, 하산 4시간) 가 가장 유명합니다. 신주쿠역 고속버스 터미널에서 가와구치코역을 가는 버스가 자주 있습니다. (1시간 한번이었던 걸로 기억) 현장 구매는 좌석이 없으니 온라인 예약을 하라는 글들이 종종 있었는데 저는 현장 구매 했었고 좌석이 넉넉하게 남은 건 아니지만 공석이 종종 있었던 것 같습니다. 이곳에서 고속버스를 타고 2시간 정도면 가와구치코역에 도착하게 됩니다. 저는 가와구치코역에서 오후 6시 쯤 버스를 타고 후지산 고고메 = 5합목 (5th station) 으로 이동했습니다. 가와구치코역에서 후지산 고고메로 가는 버스 또한 1시간에 .. 공감수 3 댓글수 0 2024. 8. 21.
Paper review | Radiomics in stroke neuroimaging: techniques, applications, and challenges Introduction Stroke is a vascular event characterized by a sudden onset of focal neurologic deficits in the relevant part of the central nervous system, including ischemic stroke, intracerebral hemorrhage (ICH), and subarachnoid hemorrhage (SAH) -> 뇌졸중은 신경학적 결손이 나타나는 혈관 사건으로, 허혈성 뇌졸중, 뇌내 출혈(ICH), 지주막하 출혈(SAH) 등을 포함전 세계적으로 뇌졸중은 사망과 장애의 주요 원인 중 하나로, 뇌졸중 이후 치료에 상당한 경제적 비용이 소요.인구 증가 및 고령화로 뇌졸중 부담 더욱.. 공감수 2 댓글수 0 2024. 8. 13.
Paper review | OpenXAI: Towards a Transparent Evaluation ofPost hoc Model Explanations 논문 링크: https://proceedings.neurips.cc/paper_files/paper/2022/file/65398a0eba88c9b4a1c38ae405b125ef-Paper-Datasets_and_Benchmarks.pdf 부록 링크: https://proceedings.neurips.cc/paper_files/paper/2022/file/65398a0eba88c9b4a1c38ae405b125ef-Supplemental-Datasets_and_Benchmarks.pdf 1. Introduction 예측 모델이 점점 더 중요 분야(예: 의료, 법률, 금융)에 배치됨에 따라, 이러한 모델의 예측 결과를 의사 결정자(예: 의사, 판사)에게 설명하는 것에 대한 중요성 증가이를 위해 최근 문헌에서는.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 8. 7.
Paper review | XAI–reduct: accuracy preservation despite dimensionality reduction for heart disease classification using explainable AI 1. Introduction 심장병 (Heart disease) 은 전 세계적으로 흔한 사망 원인 중 하나임.ML 도구 및 등장은 의사가 질병의 특징과 증상과 같은 이유와 사망을 식별하는 데 도움. 지금까지 ML 모델을 사용한 심장병 연구는 설명이 부족함. ML 모델을 설명하는 데 가장 널리 사용되는 프레임워크는 LIME, SHapley Additive exPlanations (SHAP) 임. 본 연구는 심장병 분류를 설명하기 위해 SHAPASH, PDP 및 DALEX 모델을 사용한 최초의 연구임. ML 모델로 의 decision tree, random forest, support vector machine, and XGBoost 사용. 설명에 따라 특징 기여도 (feature contributions).. 공감수 1 댓글수 0 2024. 7. 31.
Paper review | Association between left atrial volume index and infarct volume in patients with ischemic stroke 1. Introduction 뇌졸중은 전 세계적으로 주요한 발병 및 사망 원인 중 하나임.기전 (mechanism) 이 알려지지 않은 뇌졸중, 즉 원인 불명 색전 뇌졸중 (embolic stroke of undetermined source, ESUS) 는 잠복 심장 색전증 (occult cardiac embolish) 이 흔한 기전으로 여겨짐.심방세동 (atrial fibrillation) 환자가 오랫동안 뇌졸중 위험이 증가하는 것으로 알려져 있었지만, 심방세동이 없는 심방병증 (atrial myopathy) 도 심장 색전증 (cardiac embolism) 및 뇌졸중의 잠재적 원인으로 인식되고 있음. 좌심방 용적 지수 (left atrial volume index, LAVI) 는 심방병증의 지표 (on.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 7. 30.
Paper review | Explainable AI approaches in deep learning: Advancements, applications and challenges 1. Introduction XAI 는 복잡한 ML 모델의 투명성과 해석성을 강화하기 위함. 결정에 대한 명확하고 이해하기 쉬운 설명을 제공하는 데 중점. AI 시스템에 대한 신뢰를 촉진하고 이해 관계자가 AI 기반 결론의 근거를 이해하고 검증할 수 있도록 하여 AI 의 책임성과 윤리적 사용을 촉진함. 2. Survey methodology 3. Application tasks of XAI for DL3.1. Healthcare 복잡한 기계 학습 모델의 의사 결정 과정을 명확히 하여 의료 전문가들 사이에서 신뢰와 자신감을 심어줌. 건강 관리 전문가들이 진단 결과의 근본적인 이유를 이해할 수 있게 함.개인 맞춤 의학 (personalized medicine) 에서 XAI를 통해 모델 예측을 명확히 하면 .. 공감수 1 댓글수 0 2024. 7. 23.
폴더 내 파일 개수 확인 (USB 파일 전송 중 일부 누락 이슈 발생) 700개 가량 폴더 내 40만 개 이르는 파일이 있었는데, 그중 600개 파일이 전송 중 누락되어 어떤 폴더에서 누락되었는지 찾아야 했음. 1. 700개 가량 폴더가 다 이동되었는지 (D path) 확인함. import osimport refolder_list_new = os.listdir("D: path")folder_list_org = os.listdir("E: path")# 괄호 내부 내용 추출함. 폴더 이름이 "(order number)_patient name" 으로 구성. p = re.compile('\(([^)]+)')list_new = []list_org = []#for name in folder_list_new: m = p.findall(name) list_new.append(.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 7. 15.
Fried wonton 만드는 법 https://www.10000recipe.com/recipe/6857426 [집밥백선생2]완탕[집밥백선생2]완탕 안녕하세요? 밥심은 국력입니다. 완탕은 밀가루로 만든 피에 돼지고기나, 채소, 새우살, 설탕, 꿀 등의 속을 채워서 만두처럼 빚어 삶은 후 닭고기 육수에 끓여 먹는 중국음식www.10000recipe.com https://www.jk-daily.co.kr/news/view.php?bIdx=17493 【레시피】 완탕 튀김 - 제이케이데일리[재료] 완탕 튀김 (2~3인분)∙ 완탕 반죽피 ··· 15장∙ 다진 돼지고기 ··· 100g∙ 다진 생강 ··· 1작은술∙ 설탕 ··· 한꼬집∙ 소금 ··· 한꼬집∙ 후추 ··· 조금∙ 술 ··· 1/2작은술∙ 간장 ·www.jk-daily.co.kr 재료 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 7. 11.
Paper review | A review of Explainable Artificial Intelligence in healthcare 1. Introduction1.1. interpretability and explainability 해석 가능성 (interpretability) 은 시스템의 의사 결정 과정을 이해할 수 있는 규칙으로 제공하는 것을 의미함. 해석 가능성은 임상 채택 (clinical adoption) 을 가능하게 하고, 더 나은 정확성을 확인하며, 의사가 AI 알고리즘이 결정을 내리는 과정을 이해하고 완화할 수 있게 함으로써 오류나 편향과 관련된 위험을 줄임. 또한 해석 가능성은 윤리적 및 법적 요구 사항 준수를 보장하고, 정보에 입각한 동의와 환자 참여를 촉진하며, 지속적인 피드백을 장려함. 설명 가능성 (explainability) 은 인간이 AI 의사 결정 과정을 접근하고 이해할 수 있도록 하는 인터페이스를 만드는.. 공감수 1 댓글수 2 2024. 7. 9.
Paper review | A Multimodal Ensemble Deep Learning Model for Functional Outcome Prognosis of Stroke Patients Introduction acute ischemic stroke 은 clinical aspects such as age, patient characteristics, cognition, treatment, comorbidities, stroke severity, and even imaging biomarkers 영향으로 인해 functional outcomes 예측이 어려움. 최근 machine learning 과 deep learning 으로 인해 성능이 매우 향상되었지만 주로 clinical data 에 의존하며 AIS 를 예측하는 데 중요한 정보가 담긴 영상 데이터 (the extent of tissue damage, penumbra*, and collateral circulation) 를 통합하지 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 7. 8.
Paper review | Numerical study of hemodynamic changes in the Circle of Willis after stenosis of the internal carotid artery 1. Introduction(요약) ischemic stroke 을 앓는 많은 환자들이 circle of willis (CoW) 협착과 함께 internal carotid artery (ICA) stenosis 를 보임. carotid artery stenosis, CoW atherosclerosis 는 뇌혈류 보상 저하 (cerebral blood flow decompensation*) 를 유발하고 ischemic stroke 발병을 촉진함. 두 부위 모두에서 stenosis 가 발생하는 이유는 알 수 없음. 따라서 이 연구에서는 ICA stenosis 가 CoW 에 미치는 혈역학적 효과를 조사함. * cerebral blood flow decompensation : 뇌의 혈류가 갑자기 악화되는 상태.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 7. 2.
인간 본성의 법칙 CH 1. p.41 감정은 우리를 내부로 향하게 만들어 누스나 현실로부터 멀어지게 한다. 그러면 우리는 분노나 불안을 계속 곱씹는다. 바깥세상을 내다보며 문제를 해결해야 할 때도 그 감정들이 마치 렌즈처럼 세상과 우리의 중간을 막고 서서 세상을 달리 보이게 만든다. 감정은 우리의 시야를 흐린다 강력한 감정의 영향을 받고 있을 때는 결코 의사결정을 내리지 않으려 했다. 그 대신 그는 자신의 느낌을 분석했다. 불안이나 분노를 느낄 때 그 속을 면밀히 들여다보면 그 감정을 정당화할 만한 이유가 없는 경우가 대부분이었고 그러면 그 감정들은 중요성을 상실했다. p.43 표도르 도스토옙스키 중에서 p.51 인간은 끊임없이 감정을 느끼고 그 감정은 계속해서 인간의 생각을 물들인다. 감정은 내 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 26.
ChatGPT 번역기 사용과 높은 표절률 한국어로 논문을 작성하고 ChatGPT 를 통해 영어로 번역을 했는데 표절률이 무려 60% 가 나왔다. GPT 킬러 (GPT 가 생성했다고 의심 받는 문장) 을 줄이기 위한 노력을 작성해보았습니다. 1. ChatGPT 에 자세하게 명령을 해서 모든 문단을 다시 재구성 했습니다. 예를 들어서 "현재 표절률이 너무 높게 나오니 낮은 표절률을 목표로 academic sentences 로 작성해달라"고 했는데 오히려 표절률이 66% 로 증가했습니다. 2. Copilot 을 통해 모든 문단을 재구성해보았습니다. 이때도 명령문을 "현재 GPT 표절률이 높게 나오니 낮추는 방향으로 작성해달라"고 했습니다. 표절률은 59% 로 감소했지만 여전히 높은 표절률을 보였습니다. 3. step 1, step 2 에서 카피.. 공감수 2 댓글수 0 2024. 6. 26.
이것도 저것도 아닌 것에 대한 인도인의 사유 https://www.dbpia.co.kr/pdf/pdfView.do?nodeId=NODE06090356&googleIPSandBox=false&mark=0&ipRange=false&b2cLoginYN=false&aiChatView=B&readTime=15-20&isPDFSizeAllowed=true&accessgl=Y&language=ko_KR&hasTopBanner=true DBpia논문, 학술저널 검색 플랫폼 서비스www.dbpia.co.kr 인도를 경험해본 사람은 대체로 현대 인도인들의 교묘한 언술에 쉽게 낭패를 본 적이 한 두 번은 있을 것이다. 예를 들어, A 지점에서 B 지점으로 가기 위해 A 지점에서 택시기사에게 1천원을 주기로 하고 흥정하면 당연히 "노 프라블럼"으로 대꾸한다. 하지만 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 21.
Paper review | Hemodynamic Impairment of Blood Pressure and Stroke Mechanisms in Symptomatic Intracranial Atherosclerotic Stenosis 이 연구는 유증상 두개내 죽상동맥경화증 관련 뇌졸중 기전 (뇌졸중이 발생하는 원리 및 과정) 에서 혈역학적 혈압 장애를 밝히고 해당 질환에서 혈압을 관리할 때 혈역학적 평가가 수행되어야 함을 강조함. (영어 오타 수정 필) intracranial atherosclerotic stenosis (ICAS) 뇌 안의 동맥에 죽상경화 플라크 (Atherosclerotic Plaque) 가 쌓여 혈류를 제한하는 질환임. 이 병변은 주로 뇌의 주요 동맥, 예를 들어 대뇌동맥, 추골동맥, 및 기저동맥 등에 발생함. Introduction ICAS 는 허혈성 뇌졸중의 주요 원인으로 떠오르고 있으며 예후가 좋지 않음. 유증상 ICAS 의 뇌졸중 기전에는 artery-to-artery embolism (a result.. 공감수 1 댓글수 0 2024. 6. 14.
EndNote 여러 개 파일 병합 A 엔드노트 파일에 B 엔드노트 파일을 합치고자 하는 경우. B 엔드노트 파일을 Export 한 다음, A 엔드노트 파일에서 Import 하면 됨. 1. B 엔드노트 파일의 references 들을 모두 드래그함. (이유는 모르겠음. 드래그 안 하면 임포트 시 레퍼런스 하나만 추가됨.) 2. File - Export - (파일 이름 - temp / 파일 형식 - *.txt / Output style - EndNote Export) 3. A 엔드노트 파일에서 File - Import - File - (Import - temp / Import Option - Endnote Import / Duplicates - Import All / Text Translation - No Translation).. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 12.
Electro deluxe - Let's go to work Electro deluxe - Let's go to work 이런 재즈 음악을 좋아한다면 Roy Hargrove & RH factor , Nils Landgren Funk Unit 도 추천해주심. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 11.
확산텐서자기공명영상(Diffusion Tensor MRI) 원리 https://www.jkns.or.kr/upload/pdf/0042004103.pdf ; 이 글 참고함. 확산텐서자기공명영상 (Diffusion Tensor MRI, DTI) : 뇌백질 (White matter) 의 신경로를 관측하는 기술. 뇌백질의 관 (tract) 을 따라 물 분자의 움직임을 관찰할 수 있는데 이 뇌의 전화선이라고 할 수 있는 White matter tract 이 제대로 연결되어 있지 않으면 인지 기능에 문제. 뇌백질은 뇌회백질(Grey matter) 과는 다르게 축삭 (axon) 들이 일정한 방향으로 배열되어 있어 물분자들이 일정한 방향으로 확산되는 비등방성 (anisotropy) *, 방향성이 존재하는데 확산텐서자기공명영상은 기존의 영상으로 알기 어려운 이러한 뇌백질의 특성을.. 공감수 0 댓글수 1 2024. 6. 11.
몽골 홉스골 (Khovsgol Lake) 자유 여행 일정 및 경비 -2022년 버전 2022년 8월에 다녀온 몽골 홉스골 자유 여행 일정 및 경비 입니다. 총 경비는 120만원 (?) 이내였고 한 끼 식사는 약 8,000원 정도로 일주일 동안 20만원 채 안 쓴 것 같습니다. 몽골 유심은 국내에서 13,600원 정도였고 환전은 35만원 정도 했습니다. * 알고 있으면 좋은 점 - 드래곤 버스터미널에서 무릉 갈 때 버스 현장 구매시 직원 분들이 한국어/영어 모두 못하셨습니다. 제 경우엔 공항에서 한국어를 유창하게 하시는 택시 기사분을 만나서 카카오톡 아이디를 교환했고 이분께 도움을 받은 적이 있네요. 국내 몽골 여행 네이버 카페 같은 곳 보면 현지 택시 기사분 홍보글 등이 있는데 미리 연락하고 가면 픽업 서비스나 통역 등 도움을 많이 받을 수 있습니다.- 미셸 캠프 사장님께서 한국어를 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 10.
fMRI 원리 fMRI 는 functional Magnetic Resonance Imaging 약자임. 뇌 속 혈액은 산소를 함유한 헤모글로빈을 포함하고 있음. 뇌 활동이 증가하면 혈류와 함께 산소 함량이 증가함. 헤모글로빈의 자기적 특성은 산소 상태에 따라 변화함. 자기적 특성이 변화할 때 발생하는 자기 공명 신호를 감지하여 이미지를 생성함. 뇌의 다양한 부위에서 변화를 측정하여 활동을 추적할 수 있음. 뇌의 어떤 부위가 사용될 때 산화 헤모글로빈 (산소와 결합된 헤모글로빈) 농도는 증가하고 환원 헤모글로빈 (산소가 분리된 헤모글로빈) 농도는 감소함.* 산화 헤모글로빈은 자성을 띄지 않지만 환원 헤모글로빈은 자성을 띌 수 있음. 이로 인해 proton 의 자기장 내 반응성에 영향을 미침. 이에 따라 MRI 촬영 .. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 10.
MRI 원리 1. Gradient vector MRI 기기를 통해 전압과 전류를 다르게 흘리면 자장 (B) 을 경사지게 할 수 있음. Z 코일은 Z축으로 자장을 변화시킴. 이 자장의 변화로 공명 주파수가 틀어짐. iso center 를 중심부라고 할 때 중심부에서 양쪽으로 멀어질 수록 서로 다른 공명 주파수를 가지게 됨. gradient 가 형성되어 있을 경우 각 proton 은 위치 의존적인 고유 진동수로 resonance 됨. 경사도에 따라 그 주파수 값은 변하게 됨. 위치 의존적인 주파수 값으로 인해 주파수에 따른 위치 확인이 가능해짐. 즉, Z 코일은 원하는 slice 의 위치에서 영상을 얻고자 걸어주는 자장 코일임. 경사가 크면 얇은 두께를 가지지만 noise 생성이 쉬움. 경사가 작으면 큰 두께를 가지지만.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 10.
UserWarning: h5py is running against HDF5 1.10.6 when it was built against 1.10.4, this may cause problems _warn(("h5py is running against HDF5 {0} when it was built against {1}, " 해당 에러는 tensorflow 를 conda 를 통해 설치할 경우 종종 발생하는 것 같음. 심플하게는 h5py 혹은 hdf5 재설치하면 해결되는 것 같았음. 그게 아니라면 시스템 변수 관련 해결 방법이 있었음. 내 경우엔 base environment 에선 hdf5 버전이 1.10.4 였는데 new environment 에선 hdf5 버전이 1.10.6 이었음. 구글링해서 나온 해결책 모두 안 먹혔음. 1. conda 를 통한 해결 방법 https://stackoverflow.com/questions/57842565/hdf5-library-version-error-hdf5-ver-1-10-4?fbclid=IwZXh0bgNhZW0CMTAAAR2ShpeHNM62fBE4pCXqM4AVsEUa3tS87GQv.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 10.
Applying Shap to Tensorflow 2.3.0 # tensorflow 2.3.0 버전에 shap (xai) 적용하다 겪은 시행착오 *모듈 버전: python==3.8.19, tensorflow==2.3.0, numpy==1.22.0, pandas==1.0.1 (본래 1.22였음.)* 1. 최소 모듈 조건 및 에러 분석 1) python 2) numpy > 1.22 ; shap module 조건 3) tensorflow 4) AttributeError: 'DataFrame' object has no attribute 'dtype' -> numpy & pandas 호환 문제 때문에 발생하는 에러 -> pandas > 1.0.1 / numpy https://cosmosproject.tistory.com/469) 2. AttributeError: 'Dat.. 공감수 0 댓글수 0 2024. 6. 10.
MRI 원리 참고한 글 : https://karl6885.github.io/neuroscience/2018/09/09/MRI-made-easy-1/ MRI 쉽게 이해하기 (1) 개요의료영상 중 가장 대표적인 MRI에 대해 쉽게 이해해보는 글.karl6885.github.io MRI 작동 순서 1. 자석 속 환자 2. 전자기파 인가 3. 전자기파 회수 4. 방출되는 신호 5. 이미지 재구성 1. 자석 속 환자 원자는 원자핵과 전자들로 구성됨. 원자핵엔 양의 전하를 가진 proton이 있음. 지구는 거대한 자기장임. proton은 지구와 같은 방향으로 돌고 있는데 나란히 혹은 거꾸로 정렬됨. 거꾸로 정렬된 proton이 에너지가 더 큼.* 또한 magentic field (B) 를 가지고 있어 하나의 작은 자석으로 간.. 공감수 1 댓글수 2 2024. 6. 10.

문의안내

티스토리
로그인
고객센터

티스토리는 카카오에서 사랑을 담아 만듭니다.